More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3168 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  72.79 
 
 		 472 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  73.09 
 
 		 482 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  74.35 
 
 		 472 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 464 aa  907    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  89.83 
 
 		 511 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  71.52 
 
 		 487 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  73.98 
 
 		 487 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  73.41 
 
 		 489 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  64.94 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  63.85 
 
 		 472 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  67.85 
 
 		 486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  63.89 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  61.29 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  62.26 
 
 		 486 aa  548  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  60.43 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  62.63 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  62.97 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  61.23 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  61.45 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  63.26 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  60.81 
 
 		 481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  60.52 
 
 		 476 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  58.7 
 
 		 475 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  58.79 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  60.95 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 		 476 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  61.38 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  61.32 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  62.67 
 
 		 495 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  54.72 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  60.72 
 
 		 502 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  57.61 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  60.53 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  61.4 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  61.18 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  61.18 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.83 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  58.77 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.62 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  47.05 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.57 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.25 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.26 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  45.9 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  43.18 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.31 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44.04 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  45.45 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  51.13 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  45.09 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.64 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  45.23 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.69 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  49.32 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  45.39 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  46 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  47.33 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  45.85 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.69 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  45.39 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  46.94 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.6 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>