More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5449 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  70.59 
 
 		 480 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  74.28 
 
 		 482 aa  673    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  72.98 
 
 		 486 aa  644    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  71.9 
 
 		 472 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  74.62 
 
 		 495 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  82.22 
 
 		 465 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  70.87 
 
 		 472 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 		 500 aa  663    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 463 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  70.81 
 
 		 479 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  70.37 
 
 		 474 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  76.2 
 
 		 485 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  72.98 
 
 		 484 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  72.45 
 
 		 481 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  73.1 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  68.98 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  74.72 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  69.28 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  72.67 
 
 		 476 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  74.61 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  72.02 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  73.27 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  68.08 
 
 		 478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  69.89 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  61.82 
 
 		 470 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  63 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  63.8 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  60.56 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  62.97 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  62.89 
 
 		 511 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  63.56 
 
 		 486 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  59.16 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  59.3 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  61.32 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  59.73 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  57.71 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  54.45 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.99 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.36 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  46.02 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 459 aa  408  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  49.1 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  47.05 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  45.69 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  47.48 
 
 		 472 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.66 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  44.13 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  48.52 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  46.92 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.61 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  48.18 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  43.48 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.86 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 		 466 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  43.67 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  47.17 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  45.58 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  43.04 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  44.35 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  46.15 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  46.48 
 
 		 467 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  43.25 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  46.4 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  41.77 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>