More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0345 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  68.71 
 
 
460 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  69.3 
 
 
456 aa  669    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  100 
 
 
459 aa  924    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  58.21 
 
 
459 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  59.03 
 
 
458 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  62.33 
 
 
464 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  59.87 
 
 
461 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  61.71 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  57.02 
 
 
461 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  58.77 
 
 
441 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  58.69 
 
 
467 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  56.54 
 
 
458 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 
458 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  56.76 
 
 
458 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.75 
 
 
458 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  53.24 
 
 
466 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  57.79 
 
 
464 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  53.64 
 
 
462 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
458 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
462 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.1 
 
 
458 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
462 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
461 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  54.63 
 
 
459 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
462 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
462 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
462 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
463 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  52.76 
 
 
462 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
463 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
462 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 
458 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  55.16 
 
 
469 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  56.42 
 
 
464 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 
462 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  57.18 
 
 
469 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  56.7 
 
 
467 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  55.04 
 
 
462 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 
478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  53.74 
 
 
462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  53.95 
 
 
491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  55.86 
 
 
465 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
499 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  55.07 
 
 
467 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
464 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
464 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  55.16 
 
 
461 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 
464 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  55.31 
 
 
464 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
464 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
462 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
481 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 
462 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  54.34 
 
 
464 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  55.16 
 
 
459 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  54.63 
 
 
468 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  54.87 
 
 
464 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
464 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  53.55 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  55.24 
 
 
485 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
461 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 
468 aa  501  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  55.33 
 
 
466 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  55.6 
 
 
465 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 
474 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 
467 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 
457 aa  501  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 
475 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 
462 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  53.67 
 
 
461 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  52.42 
 
 
457 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  56.16 
 
 
463 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  53.23 
 
 
461 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
463 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  52.09 
 
 
460 aa  495  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
461 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  54.44 
 
 
462 aa  491  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  50 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
466 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  53.63 
 
 
467 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
459 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
461 aa  491  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00111  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
459 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00111  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
459 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
463 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  48.14 
 
 
459 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  48.14 
 
 
459 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
466 aa  481  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  51.51 
 
 
485 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  52.95 
 
 
468 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 
479 aa  475  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  51.65 
 
 
465 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0012  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
459 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>