More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3155 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  100 
 
 
481 aa  944    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  72.45 
 
 
463 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  75 
 
 
471 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  72.59 
 
 
465 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  71.15 
 
 
474 aa  675    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  73.12 
 
 
476 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  74.36 
 
 
480 aa  695    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  72 
 
 
472 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  71.34 
 
 
484 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  73.65 
 
 
486 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  75.84 
 
 
476 aa  671    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  74.68 
 
 
500 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  76.67 
 
 
472 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  74.79 
 
 
479 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  72.91 
 
 
470 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  72.53 
 
 
478 aa  632  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  71.37 
 
 
502 aa  617  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
490 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  67.09 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  64.67 
 
 
470 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  60.12 
 
 
505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  70.76 
 
 
495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  69.31 
 
 
485 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  68.83 
 
 
470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  68.83 
 
 
470 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  68.61 
 
 
470 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  68.61 
 
 
470 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  68.61 
 
 
470 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  59.5 
 
 
487 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  67.32 
 
 
470 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 
472 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  59.12 
 
 
482 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  60.6 
 
 
472 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  61.67 
 
 
511 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  60.81 
 
 
464 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  61.14 
 
 
486 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 
487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  60.08 
 
 
489 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  53.97 
 
 
475 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.53 
 
 
488 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  55.67 
 
 
477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  55.25 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  51.39 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  53.23 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
461 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.97 
 
 
459 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.56 
 
 
478 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  39.83 
 
 
461 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  46.14 
 
 
463 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 
466 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
455 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  46.27 
 
 
460 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
455 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  46.71 
 
 
460 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.2 
 
 
464 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
466 aa  388  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  46.54 
 
 
460 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  44.85 
 
 
472 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  48.38 
 
 
455 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  47.25 
 
 
463 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  48.59 
 
 
454 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  47.17 
 
 
463 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  43.61 
 
 
466 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
463 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  43.53 
 
 
467 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  41.04 
 
 
458 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  48.52 
 
 
505 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 
463 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  44.83 
 
 
461 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  46.2 
 
 
478 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.22 
 
 
456 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  43.7 
 
 
469 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.01 
 
 
468 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  43.56 
 
 
466 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 
462 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  43.63 
 
 
467 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 
466 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  43.07 
 
 
466 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.79 
 
 
461 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  43.75 
 
 
441 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  45.02 
 
 
462 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  43.07 
 
 
493 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  47.13 
 
 
465 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  45.82 
 
 
471 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
460 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  46.1 
 
 
465 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  45.61 
 
 
459 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 
467 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  46.15 
 
 
458 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 
466 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  44.82 
 
 
476 aa  372  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
462 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  45.62 
 
 
469 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  44.56 
 
 
487 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  43.51 
 
 
473 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
466 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  40.79 
 
 
504 aa  371  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  46.51 
 
 
467 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  44.28 
 
 
469 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>