More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4987 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 488 aa  984    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  62.69 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  54.41 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  53.8 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  54.01 
 
 		 500 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  54.45 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  53.15 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  54.21 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  50.52 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  53.66 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 		 472 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  50.97 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  53.53 
 
 		 481 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  50.62 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  55.68 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  49.79 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  51.83 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  54.42 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 		 484 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  53.23 
 
 		 476 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  51.52 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  48.81 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 		 486 aa  428  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  51.27 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  50.43 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  53.47 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  52.4 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  53.79 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  43.76 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  45.22 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  44.04 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.79 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  43.47 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  39.78 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  42.98 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  46.4 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  45.37 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 		 478 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  41.23 
 
 		 466 aa  363  4e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  39.37 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  43.4 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  42.54 
 
 		 473 aa  363  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  41.87 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 471 aa  362  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  43.53 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  42.11 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  43.56 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  43.23 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  43.42 
 
 		 499 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 		 464 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 		 464 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  39.06 
 
 		 479 aa  358  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 		 469 aa  359  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  41.23 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  44.97 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 		 464 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 		 469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 		 464 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  41.32 
 
 		 481 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 		 459 aa  356  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  42.44 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  39.22 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  43.69 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  41.02 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>