More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0184 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  91.38 
 
 		 464 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 468 aa  963    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  70.81 
 
 		 465 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  98.49 
 
 		 464 aa  943    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  92.89 
 
 		 464 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  93.53 
 
 		 464 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  68.36 
 
 		 457 aa  658    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  76.72 
 
 		 469 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  71.93 
 
 		 467 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  94.18 
 
 		 464 aa  913    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  91.16 
 
 		 464 aa  882    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  70.56 
 
 		 462 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  74.51 
 
 		 466 aa  722    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  68.17 
 
 		 478 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  74.89 
 
 		 469 aa  719    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  76.79 
 
 		 467 aa  709    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  98.92 
 
 		 464 aa  946    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  69.25 
 
 		 457 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  74.28 
 
 		 467 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  70.42 
 
 		 468 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  90.95 
 
 		 464 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  90.73 
 
 		 464 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  71.74 
 
 		 475 aa  663    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  69.16 
 
 		 491 aa  667    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  99.79 
 
 		 499 aa  959    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  67.98 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  65.78 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  63.09 
 
 		 476 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  64.59 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  65.3 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  65.64 
 
 		 468 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  62.31 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  65.34 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  64.43 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  65.48 
 
 		 468 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  62.1 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  61.83 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  64.63 
 
 		 485 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  63.54 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  65.7 
 
 		 469 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  65.56 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  61.55 
 
 		 483 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  65.03 
 
 		 490 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  64.89 
 
 		 469 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  65.11 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  65.19 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  62.18 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  62.18 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  65.03 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  61.42 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 		 458 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  64.81 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  64.97 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  64.81 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  61.06 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  61.69 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  60.94 
 
 		 485 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  60.67 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  60.84 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  58.74 
 
 		 476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  61.37 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  59.62 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  58.85 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  54.41 
 
 		 459 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  56.95 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 460 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  56.95 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  54.76 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  54.12 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  55.78 
 
 		 459 aa  504  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 		 476 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  54.98 
 
 		 471 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  55.22 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  55.96 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  54.11 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 		 493 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 		 461 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  53.42 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  55.77 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  52.92 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>