More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0675 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  72.51 
 
 		 490 aa  726    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 505 aa  1033    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  62.55 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  61.65 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  60.98 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  61.77 
 
 		 470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  63.44 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  58.64 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  60.99 
 
 		 484 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  58.09 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  60.12 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  57.8 
 
 		 486 aa  561  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  59.01 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  59.08 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 		 472 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  59.16 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  59.03 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 		 482 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  54.72 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  54.01 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  50.82 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  55.05 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  50.52 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 		 489 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 470 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  56.83 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  52.17 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  50.64 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  51.5 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  51.29 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  42.39 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  43.79 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  44.92 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  44.28 
 
 		 458 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  40.35 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  42.6 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  44.16 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  43.74 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  42.77 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  41.56 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 464 aa  349  6e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 464 aa  349  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  39.49 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  41.68 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0264  argininosuccinate lyase  45.13 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.139923 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  44.71 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  43.15 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  42.14 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  40.21 
 
 		 493 aa  347  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 		 455 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  39.18 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  346  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  39.69 
 
 		 462 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  42.26 
 
 		 460 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  39.69 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  41.16 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  42.14 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  40.86 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  39.87 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  40.95 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  40.82 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  41.28 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  40.95 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  41.98 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  41.59 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  40.66 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  40.3 
 
 		 467 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  40.9 
 
 		 468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  41.1 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 		 472 aa  339  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  41.5 
 
 		 466 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  41.94 
 
 		 469 aa  339  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  39.04 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  40.35 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  40.35 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  43.62 
 
 		 441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>