More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2051 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  77.8 
 
 		 471 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  72.14 
 
 		 486 aa  664    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  72.49 
 
 		 474 aa  668    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 476 aa  948    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  82.45 
 
 		 472 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  76.56 
 
 		 472 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  73.12 
 
 		 481 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  77.16 
 
 		 500 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  71.34 
 
 		 478 aa  643    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  73.36 
 
 		 484 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  72.26 
 
 		 479 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  72.71 
 
 		 476 aa  650    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  71.98 
 
 		 470 aa  664    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  72.83 
 
 		 480 aa  685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  69.28 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  71.67 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  70.13 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  66.03 
 
 		 490 aa  611  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  64.52 
 
 		 482 aa  604  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  65.51 
 
 		 470 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  64.94 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  61.65 
 
 		 505 aa  594  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  64.73 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  71.14 
 
 		 495 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  70.48 
 
 		 485 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  61.12 
 
 		 482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  61.97 
 
 		 472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  62.95 
 
 		 487 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  63.48 
 
 		 486 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  65.07 
 
 		 470 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  62.3 
 
 		 487 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  63.38 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  65.94 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  54.41 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  53.83 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  55.27 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  55.48 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  43.53 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.95 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  47.51 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.58 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  46.1 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.72 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  47.75 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  44.94 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  44.93 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.84 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.65 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  45.1 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.52 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  46.15 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  43.26 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.2 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 		 473 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  45.18 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.69 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  45.53 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  45.76 
 
 		 486 aa  392  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.86 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 		 478 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  45.76 
 
 		 486 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  47.38 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  47.94 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  47.77 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  44.9 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>