More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3732 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  78.62 
 
 
471 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  70.24 
 
 
466 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  69.37 
 
 
466 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  68.13 
 
 
467 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  79.91 
 
 
471 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  68.93 
 
 
476 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  82.53 
 
 
476 aa  781    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  67.76 
 
 
467 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  100 
 
 
463 aa  943    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  68.91 
 
 
473 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  69.37 
 
 
493 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  68.2 
 
 
466 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  79.91 
 
 
471 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  83.15 
 
 
463 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  82.76 
 
 
469 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
467 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 
463 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  68.13 
 
 
455 aa  628  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 
459 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 
463 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 
463 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  65.22 
 
 
466 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  67.47 
 
 
462 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 
460 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  65.92 
 
 
478 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  67.11 
 
 
466 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  67.61 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  65.34 
 
 
465 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  65.12 
 
 
465 aa  596  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  64.68 
 
 
488 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  64.9 
 
 
465 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  65.87 
 
 
472 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  64.24 
 
 
463 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  64.9 
 
 
465 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  64.24 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  67.47 
 
 
462 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  57.55 
 
 
470 aa  565  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 
469 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  56.24 
 
 
471 aa  552  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  61.32 
 
 
458 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
464 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  60.58 
 
 
468 aa  518  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  55.84 
 
 
464 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
464 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  56.18 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.4 
 
 
464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  54.76 
 
 
468 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  55.94 
 
 
468 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  55.19 
 
 
464 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
499 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
464 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.38 
 
 
458 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  54.55 
 
 
464 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 
458 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
461 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 
458 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.16 
 
 
469 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 
458 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 
466 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 
491 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 
469 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  54.99 
 
 
457 aa  501  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
457 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 
475 aa  497  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
458 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 
458 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 
458 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.11 
 
 
467 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.08 
 
 
464 aa  491  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  54.73 
 
 
478 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  53.35 
 
 
467 aa  484  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
467 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 
461 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  54.04 
 
 
465 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.28 
 
 
467 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
468 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
504 aa  475  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
485 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 
465 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  52.84 
 
 
472 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  49.02 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  52.41 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  50.43 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  52.61 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
489 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>