More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2875 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 462 aa  926    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 462 aa  926    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 		 467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 		 491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 		 475 aa  571  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  61.01 
 
 		 478 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  62.16 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  58.33 
 
 		 476 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  58.02 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 		 465 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  59.08 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  59.51 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  61.36 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  59.38 
 
 		 468 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  57.14 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  59.46 
 
 		 469 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  57.89 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  56.95 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  56.95 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  57.24 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  57.68 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  56.56 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  58.37 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  56.55 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.73 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  56.73 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  56.51 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 		 466 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  56.74 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  58.43 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  58.37 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  56.99 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  54.91 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  56.82 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  56.38 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 		 468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  55.19 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  55.02 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  54.39 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  54.39 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  55.02 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.19 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  54.75 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.09 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  55.95 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  55.02 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 		 485 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  55.97 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 490 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  54.73 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 		 460 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  54.61 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 		 469 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  55.31 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  53.62 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  53.18 
 
 		 488 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  55.19 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  54.69 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  54.69 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  54.27 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 459 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.47 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  52.52 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>