More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3062 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  69.63 
 
 		 467 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 463 aa  935    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  69.67 
 
 		 476 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  68.68 
 
 		 466 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  68.68 
 
 		 493 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  68.55 
 
 		 466 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  70.52 
 
 		 463 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  83.48 
 
 		 471 aa  779    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  68.68 
 
 		 466 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  83.04 
 
 		 476 aa  789    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  68.34 
 
 		 467 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  83.15 
 
 		 463 aa  794    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  83.7 
 
 		 471 aa  782    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  68.33 
 
 		 467 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  68.9 
 
 		 473 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  82.72 
 
 		 471 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  70.09 
 
 		 463 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  70.52 
 
 		 459 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  70.09 
 
 		 463 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  82.57 
 
 		 469 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  69 
 
 		 462 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  70.68 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 		 466 aa  622  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  67.49 
 
 		 478 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  67.99 
 
 		 466 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  66.08 
 
 		 488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  65.65 
 
 		 465 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  70.52 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  66.52 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  66.16 
 
 		 472 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  64.77 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  64.33 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  64.11 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  57.33 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  56.24 
 
 		 471 aa  554  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  60.88 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 		 469 aa  541  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 		 458 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  56.59 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  56.06 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  57.93 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  56.71 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.6 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.61 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.96 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  55.84 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.46 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  56.43 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  56.17 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  56.71 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  56.02 
 
 		 475 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.95 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  56.28 
 
 		 464 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  55.99 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  56.43 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  55.75 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  54.97 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  54.41 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  56.37 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.26 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  55.78 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  56.85 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  54.23 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  55.88 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  53.06 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 493 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  52.71 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  54.99 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  53.81 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  55.68 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  54.74 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  54.96 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  54.21 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  54.74 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  54.74 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 		 489 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  54.74 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  51.61 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  54.74 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>