More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1710 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  69.92 
 
 		 489 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  82.12 
 
 		 493 aa  818    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  84.17 
 
 		 486 aa  842    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  84.85 
 
 		 485 aa  850    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  88.33 
 
 		 469 aa  874    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 		 468 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  69.18 
 
 		 470 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  69.43 
 
 		 469 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 490 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  70.06 
 
 		 469 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  68 
 
 		 471 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  69.43 
 
 		 468 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  70.13 
 
 		 469 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 483 aa  996    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  86.88 
 
 		 469 aa  866    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  68.53 
 
 		 468 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  68 
 
 		 471 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  69.62 
 
 		 469 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  80.42 
 
 		 467 aa  785    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  70.34 
 
 		 469 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  84.17 
 
 		 486 aa  842    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 		 490 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  69.43 
 
 		 469 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  84.06 
 
 		 465 aa  829    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  83.61 
 
 		 488 aa  831    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  77.02 
 
 		 476 aa  771    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  67.49 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  65.61 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  64.98 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  64.03 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  62.91 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  61.76 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  61.55 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  61.76 
 
 		 464 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  64.79 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 		 464 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  61.36 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  65.58 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 		 464 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  61.36 
 
 		 464 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  60.68 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  60.89 
 
 		 464 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 		 467 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  58.69 
 
 		 491 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 		 457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 		 457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  61.03 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  56.43 
 
 		 469 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  57.71 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  58.44 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  57.51 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  57.58 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  57.82 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.69 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  58.17 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  58.62 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.99 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 		 458 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  56.05 
 
 		 458 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  56.2 
 
 		 458 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  57.76 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  55.2 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  53.62 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  53.62 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.03 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  47.93 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  48.42 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  51.91 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  48.72 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  49.17 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  50.21 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  48.94 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  50.21 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  50.21 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  50.32 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  49.58 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  49.26 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  47.68 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  49.05 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  49.15 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>