More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0497 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  79.39 
 
 
471 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  79.61 
 
 
471 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  78.52 
 
 
471 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  100 
 
 
476 aa  970    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  66.81 
 
 
466 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  82.53 
 
 
463 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  83.04 
 
 
463 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  67.4 
 
 
466 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  78.83 
 
 
469 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 
467 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  67.39 
 
 
473 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  68.56 
 
 
463 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  68.56 
 
 
463 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  68.34 
 
 
463 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  68.34 
 
 
459 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 
466 aa  626  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  65.31 
 
 
493 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  64.5 
 
 
466 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  65.73 
 
 
467 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  65.43 
 
 
467 aa  621  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  67.1 
 
 
476 aa  614  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  64.84 
 
 
455 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  68.43 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  64.05 
 
 
478 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 
472 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  66 
 
 
466 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  61.89 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  63.36 
 
 
465 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  63.8 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  62.91 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  63.8 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  64.24 
 
 
465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  67.69 
 
 
462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  63.36 
 
 
465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 
465 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  60.69 
 
 
469 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 
470 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 
471 aa  545  1e-154  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  59.78 
 
 
458 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  55.22 
 
 
464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  60.58 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  55 
 
 
464 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  55 
 
 
464 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  55.6 
 
 
464 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  55 
 
 
464 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
468 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  53.38 
 
 
491 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  54.35 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  53.91 
 
 
464 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  54.77 
 
 
457 aa  501  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 
464 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
499 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  53.91 
 
 
464 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  54.77 
 
 
457 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  52.81 
 
 
468 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 
464 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.48 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  52.99 
 
 
458 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 
468 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.73 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  53.35 
 
 
469 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  53.22 
 
 
458 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 
458 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
478 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.69 
 
 
475 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  53.88 
 
 
462 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  54.3 
 
 
467 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  51.65 
 
 
461 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
458 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
458 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  53.27 
 
 
469 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
458 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
458 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.85 
 
 
467 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
461 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  52.12 
 
 
467 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  53.01 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  52.28 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
459 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
465 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
463 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50 
 
 
461 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
468 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  50 
 
 
476 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  51.09 
 
 
469 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  52.84 
 
 
465 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
466 aa  462  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
464 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  50.75 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  49.14 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
460 aa  457  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
469 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
469 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>