More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3748 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  82.75 
 
 		 458 aa  801    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  97.6 
 
 		 458 aa  926    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  72.49 
 
 		 461 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  83.41 
 
 		 458 aa  802    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  80.79 
 
 		 458 aa  778    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 458 aa  944    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  83.19 
 
 		 458 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  79.26 
 
 		 458 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  64.48 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  63.16 
 
 		 467 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  61.28 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  64.35 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  63.46 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  62.01 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  61.79 
 
 		 464 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  61.87 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  61.87 
 
 		 464 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  61.76 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  60.4 
 
 		 478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 		 475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  60.98 
 
 		 459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  61.21 
 
 		 465 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  61.37 
 
 		 464 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  61.66 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  58.76 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  61.74 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  59.56 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  58.67 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  57.87 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  57.65 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 		 491 aa  552  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  57.87 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  58 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  60.4 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  57.65 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  57.56 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  57.86 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  58.54 
 
 		 470 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 		 464 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  57.52 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  57.39 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  56.98 
 
 		 462 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  56.73 
 
 		 465 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  56.29 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  59.5 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  56.98 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 		 493 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  56.86 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  56.3 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  56.62 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  54.72 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  57.49 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  56.86 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 486 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  56.64 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  55.56 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 486 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 		 468 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  56.42 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  56.54 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  55.95 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 		 490 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  57.08 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  55.56 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 489 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  56.19 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 		 459 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  56.35 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  58.11 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  56.54 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  56.85 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  56.85 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  56.63 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  56.35 
 
 		 468 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>