More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1024 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  69.52 
 
 
464 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  67.98 
 
 
468 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  70.99 
 
 
478 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  69.3 
 
 
464 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  71.24 
 
 
467 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  68.86 
 
 
464 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  66.16 
 
 
466 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  69.15 
 
 
475 aa  644    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  69.52 
 
 
464 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  68.32 
 
 
467 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  69.51 
 
 
464 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  68.2 
 
 
464 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  65.58 
 
 
491 aa  634    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  70.18 
 
 
464 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  69.47 
 
 
469 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  70.27 
 
 
467 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  69.53 
 
 
469 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  100 
 
 
465 aa  938    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  75.92 
 
 
468 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  69.52 
 
 
464 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  67.98 
 
 
499 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  69.89 
 
 
465 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  67.76 
 
 
464 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  64.84 
 
 
462 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  64.02 
 
 
457 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  64.02 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  66 
 
 
463 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  63.13 
 
 
476 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  63.1 
 
 
468 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  62.53 
 
 
470 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 
471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  63.53 
 
 
469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  60 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  62.95 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  63.17 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 
462 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 
462 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  61.62 
 
 
468 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  62.64 
 
 
467 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  60.96 
 
 
485 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  60.86 
 
 
462 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 
472 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  60.22 
 
 
465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 
468 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 
469 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  58.41 
 
 
458 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 
489 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 
490 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 
458 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  58.06 
 
 
461 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  61.26 
 
 
469 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  60.67 
 
 
468 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 
469 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  61.26 
 
 
469 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  61.26 
 
 
469 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
490 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  61.04 
 
 
469 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  57.89 
 
 
493 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
469 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 
458 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  57.98 
 
 
476 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  58.31 
 
 
458 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  58.24 
 
 
486 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  57.72 
 
 
458 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  58.24 
 
 
486 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 
469 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 
458 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  57.76 
 
 
483 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.49 
 
 
458 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 
485 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 
469 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  57.68 
 
 
488 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  56.93 
 
 
464 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 
464 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
460 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  55.48 
 
 
469 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  56.7 
 
 
476 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
459 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
458 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 
493 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 
466 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
459 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  56.66 
 
 
478 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  56.24 
 
 
463 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  53.36 
 
 
466 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 
467 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  53.36 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 
471 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
462 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 
471 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 
463 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 
463 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>