More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2677 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  100 
 
 
469 aa  954    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 
458 aa  739    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  64.57 
 
 
478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 
468 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  62.69 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  63.64 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  63.86 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  62.31 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  62.94 
 
 
466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  62.94 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  62.08 
 
 
463 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 
466 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  61.4 
 
 
473 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  62.14 
 
 
463 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  62.31 
 
 
476 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
459 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
463 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  62.14 
 
 
465 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  61.32 
 
 
455 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  62.75 
 
 
462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  62.23 
 
 
460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  61.39 
 
 
471 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  61.39 
 
 
471 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  62.36 
 
 
465 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  61.61 
 
 
471 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  61.93 
 
 
469 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  61.71 
 
 
465 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  60.69 
 
 
476 aa  558  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 
463 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  59.52 
 
 
466 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  61.52 
 
 
465 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  61.49 
 
 
465 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  61.05 
 
 
488 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  61.43 
 
 
463 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  62.14 
 
 
466 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  61.74 
 
 
462 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  59.3 
 
 
471 aa  531  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 
463 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  53.83 
 
 
471 aa  522  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  57.02 
 
 
472 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
462 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  52.26 
 
 
468 aa  471  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
464 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  53.66 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
464 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.64 
 
 
464 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  52.22 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
464 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
461 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 
460 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.31 
 
 
467 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
468 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  51 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.97 
 
 
467 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
475 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
458 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
457 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
458 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
458 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 
460 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
458 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
463 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  48.72 
 
 
472 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  48.61 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.95 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  48.72 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  48.36 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  48.61 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
465 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
489 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  46.39 
 
 
458 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
467 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  48.48 
 
 
466 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 
458 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 
476 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 
463 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  50 
 
 
469 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
469 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
469 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>