More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0201 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  100 
 
 
468 aa  928    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  67.33 
 
 
458 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  65.8 
 
 
469 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  64.44 
 
 
469 aa  578  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  64.11 
 
 
471 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  64.11 
 
 
471 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  63.6 
 
 
478 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  64.8 
 
 
465 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  63.89 
 
 
471 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  65.02 
 
 
476 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  61.96 
 
 
467 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  62.33 
 
 
465 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  61.56 
 
 
472 aa  561  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  61.45 
 
 
467 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  61.85 
 
 
466 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  62.78 
 
 
488 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  62.72 
 
 
455 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  63 
 
 
465 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  61.66 
 
 
467 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  60.18 
 
 
476 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  60.35 
 
 
463 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  61.47 
 
 
460 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  62.5 
 
 
471 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  62.02 
 
 
463 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  62.33 
 
 
465 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  62.02 
 
 
463 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  62.56 
 
 
465 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  59.43 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  61.52 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  59.43 
 
 
493 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  61.69 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  58.99 
 
 
466 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  62.36 
 
 
463 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 
473 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  63.45 
 
 
462 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  58.33 
 
 
466 aa  525  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  60.99 
 
 
462 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 
466 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
471 aa  498  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  63.45 
 
 
462 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
470 aa  489  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
462 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
462 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  53.38 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
468 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  51.94 
 
 
465 aa  455  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  53.64 
 
 
465 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  54.2 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
457 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
467 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
491 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
464 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
469 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  52 
 
 
468 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
478 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  52.68 
 
 
463 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 
458 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  52 
 
 
469 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  51.52 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
464 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  48.18 
 
 
486 aa  438  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  47.32 
 
 
493 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
490 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50 
 
 
467 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  51.89 
 
 
469 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
458 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
471 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 
458 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
490 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
464 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
464 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
469 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  48.18 
 
 
486 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
469 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
475 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
464 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
468 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
465 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
462 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
470 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
467 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 
465 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 
460 aa  435  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
469 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  51.56 
 
 
469 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
469 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  47.23 
 
 
461 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>