More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2700 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  100 
 
 
478 aa  966    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  80.95 
 
 
464 aa  773    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  53.41 
 
 
466 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  53.58 
 
 
493 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  53.63 
 
 
466 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
461 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  51.71 
 
 
469 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
468 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.62 
 
 
464 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  52.39 
 
 
463 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 
467 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
463 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
458 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  53.04 
 
 
459 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
468 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 
464 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  54.16 
 
 
467 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  51.82 
 
 
473 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  52.07 
 
 
460 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  51.5 
 
 
467 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 
463 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  53.01 
 
 
468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  53.98 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  53.98 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  51.3 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  53.01 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  51.53 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  51.19 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
466 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  53.47 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.97 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  49.68 
 
 
485 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 
466 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 
489 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
458 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  52.4 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
490 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 
471 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  52.07 
 
 
469 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
458 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
459 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
458 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  54.79 
 
 
462 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
466 aa  464  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
490 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  53.26 
 
 
455 aa  461  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  51.94 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
462 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  52.33 
 
 
470 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
467 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  47.31 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
472 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
481 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
476 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
467 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
463 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
469 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
469 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
462 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
459 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
469 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  52.71 
 
 
478 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
462 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
458 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  46.37 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>