More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1123 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  75.27 
 
 		 466 aa  748    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  100 
 
 		 458 aa  959    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  74.84 
 
 		 460 aa  743    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.98 
 
 		 458 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  56.32 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.75 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.81 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  52.95 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  51.92 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 		 469 aa  484  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 461 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.65 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  48.24 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 		 463 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  47.82 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  48.37 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  46.22 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 		 465 aa  458  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  47.11 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  47.7 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  47.6 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  48.36 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  47.26 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>