More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2490 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  100 
 
 
466 aa  954    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  58.11 
 
 
461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  58.63 
 
 
458 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  58.9 
 
 
467 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 
458 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  57.74 
 
 
458 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  57.52 
 
 
458 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 
458 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  58.19 
 
 
458 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 
458 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  55.48 
 
 
460 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 
491 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  57.71 
 
 
478 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
459 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.32 
 
 
458 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
464 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 
457 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 
469 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  56.61 
 
 
464 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  55.46 
 
 
466 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 
457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  55.65 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 
467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 
464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  56.51 
 
 
464 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
466 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  56.85 
 
 
467 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  56.33 
 
 
475 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.35 
 
 
464 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  56.07 
 
 
464 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  56.22 
 
 
464 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  55.9 
 
 
464 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  54.95 
 
 
462 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  55.33 
 
 
459 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  55.85 
 
 
464 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 
468 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  55.03 
 
 
465 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
459 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.47 
 
 
461 aa  494  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  53.35 
 
 
459 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
461 aa  491  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  55.01 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  53.83 
 
 
459 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  54.41 
 
 
467 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
462 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
463 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  55.35 
 
 
462 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
463 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 
468 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
460 aa  490  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
462 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 
464 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
459 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 
481 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
441 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  51.96 
 
 
462 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  51.31 
 
 
462 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 
465 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  51.96 
 
 
462 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
461 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 
463 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
462 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  55.15 
 
 
463 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
467 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
462 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  49.56 
 
 
458 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  47.52 
 
 
466 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  54.95 
 
 
465 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
462 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 
459 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
471 aa  472  1e-132  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
461 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  51.95 
 
 
493 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
462 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  54.47 
 
 
485 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 
459 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 
460 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
461 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
462 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
466 aa  474  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  51.09 
 
 
466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  51.39 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  50.43 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  51.39 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  51.72 
 
 
485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  53.28 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>