More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0682 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 466 aa  950    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 		 458 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  60.26 
 
 		 459 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  58.48 
 
 		 460 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  59.87 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  57.94 
 
 		 456 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  58.77 
 
 		 458 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  56.83 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  58.17 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  56.22 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.12 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.12 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  56.39 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  53.5 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.95 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  57.95 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 481 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  54.63 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 461 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  52.52 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  52.36 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  52.52 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  55.76 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  52.41 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  50.79 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  51.91 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  53.35 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  51.46 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  51.7 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  52.41 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  52.62 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  55.02 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  52.9 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.92 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  51.95 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  51.34 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  49.32 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  51.34 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  48.98 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  48.49 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.32 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  49.33 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  48.22 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  48.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 460 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  48.97 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  47.1 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 		 466 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  47.71 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 504 aa  450  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>