More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0178 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 458 aa  945    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  65.32 
 
 		 456 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  78.34 
 
 		 459 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  66.29 
 
 		 460 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 		 461 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  59.65 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  59.59 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 		 466 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  62.89 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  61.3 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  60.63 
 
 		 461 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  61.74 
 
 		 458 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  61.74 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  62.05 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  60.18 
 
 		 458 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 		 458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  57.89 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  59.38 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  58.01 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  57.02 
 
 		 459 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  58.46 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  56.25 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  56.03 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.3 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  54.61 
 
 		 462 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  55.88 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  55.13 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  54.63 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  57.69 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.13 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  54.39 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  52.22 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.41 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  53.27 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 		 467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  53.24 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  53.42 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  53.83 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  53.08 
 
 		 491 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  52.82 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  52.75 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 		 459 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  53.01 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 		 459 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  54.24 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  52.44 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 		 476 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.09 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  52.44 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  52.42 
 
 		 460 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  52.46 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  52.58 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  52.39 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  52.85 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  52.81 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  52.6 
 
 		 469 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  52.58 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 476 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  52.6 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  52.58 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.49 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 		 462 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>