More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0123 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  100 
 
 
459 aa  941    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 
462 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  57.14 
 
 
462 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  57.14 
 
 
462 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 
462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  56.7 
 
 
462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 
462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  56.92 
 
 
462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 
463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  56.1 
 
 
458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  56.25 
 
 
462 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  56.03 
 
 
462 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  56.03 
 
 
463 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
458 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 
458 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  53.98 
 
 
458 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 
461 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  53.66 
 
 
458 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  53.6 
 
 
466 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  52.77 
 
 
458 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  53.51 
 
 
459 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  52.27 
 
 
456 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
464 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
458 aa  481  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
460 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
491 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
458 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
464 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 
468 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
481 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
467 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  51.47 
 
 
469 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
468 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
461 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 
478 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
464 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
467 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.77 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
457 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
475 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 
464 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 
459 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
469 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
465 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 
464 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
459 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 
459 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
461 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 
462 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
465 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
464 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 
460 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  47.48 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  47.48 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  52.11 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 
465 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  47.48 
 
 
466 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
462 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  47.45 
 
 
467 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 
466 aa  450  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0012  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
459 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
461 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
459 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  48.14 
 
 
473 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  48.53 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  45.59 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  47.54 
 
 
463 aa  445  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 
466 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 
470 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  47.78 
 
 
467 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  47.12 
 
 
466 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
469 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  46.94 
 
 
469 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  48.86 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  47.65 
 
 
471 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>