More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1044 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  96.31 
 
 
461 aa  928    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  100 
 
 
461 aa  960    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  93.71 
 
 
461 aa  910    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.04 
 
 
458 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
461 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  53.91 
 
 
458 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 
464 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  55.61 
 
 
456 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
460 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
458 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  52.44 
 
 
464 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52 
 
 
464 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  51.79 
 
 
458 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
468 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52 
 
 
464 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52 
 
 
464 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  51.48 
 
 
467 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  52.22 
 
 
464 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 
476 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.22 
 
 
468 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 
467 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
499 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
464 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
458 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
478 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  52 
 
 
464 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  52 
 
 
459 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
459 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
464 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 
465 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52 
 
 
458 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
464 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 
481 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
475 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
485 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
462 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  471  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
459 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
468 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.95 
 
 
463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
493 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  52.05 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
466 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
457 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  50.46 
 
 
462 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  52.36 
 
 
470 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  50 
 
 
461 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
483 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
457 aa  463  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  51.24 
 
 
469 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
476 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
485 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
472 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  50 
 
 
469 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
459 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
488 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  51.47 
 
 
460 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  50 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
464 aa  448  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
466 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  49.43 
 
 
469 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
493 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
460 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  50.79 
 
 
469 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
468 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  48.86 
 
 
467 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  47.23 
 
 
470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  48.22 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  48.22 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>