More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2065 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  100 
 
 
465 aa  936    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  56.83 
 
 
464 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 
473 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
493 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
458 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
466 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  53.95 
 
 
458 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
466 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  52.8 
 
 
469 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  54.44 
 
 
469 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 
463 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  53.73 
 
 
467 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  55.92 
 
 
459 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 
463 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 
459 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 
461 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
460 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  50.44 
 
 
458 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
458 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  53.12 
 
 
466 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 
467 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 
478 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
464 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  52.4 
 
 
467 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
461 aa  475  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  55.11 
 
 
463 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  52.48 
 
 
464 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  56.67 
 
 
462 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 
481 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
458 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
468 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
458 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
459 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  51.94 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  51.09 
 
 
459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.23 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  52.07 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  53.48 
 
 
478 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 
464 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.39 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  52.93 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  52.05 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
459 aa  461  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
468 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
464 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 
462 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50 
 
 
462 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  51.62 
 
 
467 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 
471 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
499 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.37 
 
 
464 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  52.84 
 
 
476 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 
471 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  52.54 
 
 
467 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  54.79 
 
 
476 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  51.65 
 
 
457 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  50 
 
 
462 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
462 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
488 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  52.79 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  48.37 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.62 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
464 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 
463 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
457 aa  458  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  52.77 
 
 
460 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
459 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
460 aa  450  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
462 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  53.41 
 
 
463 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  50.75 
 
 
464 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  47.05 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  51.76 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>