More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1895 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  71.74 
 
 
511 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  96.3 
 
 
487 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  72.39 
 
 
464 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  100 
 
 
487 aa  958    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  70.51 
 
 
470 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  68.11 
 
 
472 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 
482 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  68.98 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  62.72 
 
 
472 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  67.48 
 
 
489 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  63.53 
 
 
472 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  61.26 
 
 
500 aa  551  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 
476 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  64.12 
 
 
486 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  58.86 
 
 
480 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  59.32 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  58.09 
 
 
474 aa  537  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 
465 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  58.4 
 
 
486 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  59.71 
 
 
481 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  58.7 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  58.69 
 
 
476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  58.86 
 
 
463 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  57.39 
 
 
475 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  58.87 
 
 
484 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  60.18 
 
 
471 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  56.87 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  57.63 
 
 
502 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  54.72 
 
 
482 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  58.58 
 
 
477 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  58.58 
 
 
477 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  56.34 
 
 
470 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
485 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  57.14 
 
 
480 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  54.6 
 
 
490 aa  475  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  58.73 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  57.67 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  50.21 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  56.92 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 
470 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  57.64 
 
 
470 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 
470 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 
470 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.49 
 
 
458 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.33 
 
 
459 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  44.99 
 
 
461 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  45.03 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
460 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  46.22 
 
 
466 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  49.31 
 
 
458 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.85 
 
 
467 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
459 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
466 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  45.51 
 
 
467 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  45.31 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.62 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 
493 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  46.22 
 
 
459 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 
466 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
463 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  45.04 
 
 
467 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  46.62 
 
 
478 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
463 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 
464 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44.12 
 
 
462 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  47.27 
 
 
456 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  47.28 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  47.71 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  43.91 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  45.38 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  41.48 
 
 
462 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1367  argininosuccinate lyase  44.88 
 
 
460 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 
461 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 
466 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.62 
 
 
459 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
462 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
476 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
461 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  44.44 
 
 
458 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 
460 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  40.35 
 
 
471 aa  392  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  46.22 
 
 
468 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
478 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.57 
 
 
441 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.11 
 
 
469 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>