More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2396 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  76.24 
 
 		 470 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  74.28 
 
 		 463 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  74.68 
 
 		 465 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  69.38 
 
 		 486 aa  654    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  68.83 
 
 		 480 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  68.41 
 
 		 479 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 482 aa  958    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  77.78 
 
 		 495 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  75 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  74.73 
 
 		 470 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  75.81 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  75.59 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  75.59 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  65.11 
 
 		 474 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  67.31 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  65.94 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  65.09 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  64.52 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  67.09 
 
 		 481 aa  591  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  67.23 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  64.19 
 
 		 472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  68.7 
 
 		 485 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  65.41 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  68.23 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  62.68 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  64.01 
 
 		 502 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 		 470 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  59.78 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  56.9 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  57.92 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  58.79 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  58.79 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  58.35 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  54.97 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  54.94 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  54.72 
 
 		 487 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  48.38 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 475 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  48.81 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  51.41 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  51.41 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.31 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  46.59 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  46.74 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  46 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  44.87 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  43.27 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  39.3 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  44.92 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.56 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  44.3 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  47.29 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  45.66 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.27 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  45.56 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  45.76 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  45.24 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  42.07 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  43.32 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  43.48 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  40.43 
 
 		 470 aa  375  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  41.48 
 
 		 460 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  45.37 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  46.34 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  43.66 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.17 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  47.51 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 		 466 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>