More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2475 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  71.98 
 
 
476 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  72.61 
 
 
500 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  71.98 
 
 
472 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  75 
 
 
478 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  69.44 
 
 
479 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  100 
 
 
470 aa  929    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  67.52 
 
 
480 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  70.02 
 
 
486 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  70.65 
 
 
472 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  68.87 
 
 
474 aa  626  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  74.11 
 
 
484 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  67.31 
 
 
482 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  68.98 
 
 
463 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  72.91 
 
 
481 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  72.43 
 
 
476 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  71.59 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  69.2 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  68.92 
 
 
502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  64.86 
 
 
490 aa  579  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  61.77 
 
 
505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  67.82 
 
 
485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  68.45 
 
 
495 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 
470 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  69.23 
 
 
470 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  67.8 
 
 
470 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  67.59 
 
 
470 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  67.59 
 
 
470 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  68.79 
 
 
470 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  62 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  62.81 
 
 
486 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  59.35 
 
 
472 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  58.62 
 
 
472 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 
464 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  57.82 
 
 
482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 
511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  56.13 
 
 
487 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  60.35 
 
 
489 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 
475 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  57.4 
 
 
487 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
480 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 
477 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 
488 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  50 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 
459 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  42.64 
 
 
462 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  42.54 
 
 
462 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  42.64 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  42.2 
 
 
462 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  42.54 
 
 
463 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  42.2 
 
 
462 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  42.2 
 
 
462 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 
463 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.98 
 
 
461 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
459 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.79 
 
 
460 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  44.3 
 
 
481 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  42.2 
 
 
462 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
454 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  42.37 
 
 
441 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
458 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
458 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.42 
 
 
478 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  41.98 
 
 
462 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  41.63 
 
 
458 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 
466 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
441 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.9 
 
 
471 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  45.61 
 
 
455 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.62 
 
 
466 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  45.18 
 
 
472 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  44.22 
 
 
458 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
469 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
459 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 
462 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  46.64 
 
 
465 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 
458 aa  373  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.83 
 
 
464 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 
458 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  42.44 
 
 
466 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  42.21 
 
 
461 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  43.57 
 
 
467 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 
465 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 
467 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  40.8 
 
 
461 aa  372  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
456 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  46.46 
 
 
475 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  40.18 
 
 
462 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 
462 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.58 
 
 
458 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 
458 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  44.18 
 
 
476 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  45.62 
 
 
464 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62615  argininosuccinate lyase  42.07 
 
 
464 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.57732  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  39.96 
 
 
487 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  43.48 
 
 
462 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  41.43 
 
 
504 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>