More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0809 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  72.51 
 
 
505 aa  726    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  100 
 
 
490 aa  991    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  66.6 
 
 
500 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  64.84 
 
 
474 aa  610  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  66.17 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  65.02 
 
 
479 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  67.61 
 
 
471 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  66.03 
 
 
476 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  63.85 
 
 
480 aa  594  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  67.02 
 
 
484 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  63.6 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  64.86 
 
 
470 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  64.6 
 
 
472 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  64.95 
 
 
476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  64.39 
 
 
465 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  63.8 
 
 
463 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 
502 aa  548  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  64.05 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  62.96 
 
 
485 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  56.9 
 
 
482 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  61.91 
 
 
495 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  57.72 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 
470 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  57.92 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  55.44 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 
464 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  59.91 
 
 
470 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
511 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  58.73 
 
 
486 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 
487 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  59.7 
 
 
470 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
470 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  60.86 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  60.86 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  60.86 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  50.62 
 
 
488 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  55.85 
 
 
489 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  54.78 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
475 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 
480 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
476 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  53.54 
 
 
477 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  53.1 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  48.81 
 
 
455 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.16 
 
 
459 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.42 
 
 
458 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  41.41 
 
 
461 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  43.84 
 
 
466 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
468 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.34 
 
 
441 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  42.22 
 
 
462 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  46.2 
 
 
454 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  43.64 
 
 
456 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  43.92 
 
 
464 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  40.69 
 
 
462 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  41.61 
 
 
459 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  44.16 
 
 
468 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  43.42 
 
 
481 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 
467 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  42.08 
 
 
463 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.89 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  42.21 
 
 
466 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
504 aa  362  6e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  42.21 
 
 
493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  44.05 
 
 
463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  46.05 
 
 
455 aa  362  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  42.21 
 
 
466 aa  362  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  40.91 
 
 
462 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.1 
 
 
460 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  40.78 
 
 
462 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  40.78 
 
 
462 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  40.91 
 
 
462 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  43.92 
 
 
441 aa  362  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  41.13 
 
 
463 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
464 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  41.79 
 
 
461 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  40.91 
 
 
463 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  40.69 
 
 
462 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  41.23 
 
 
462 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  44.59 
 
 
469 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  41.9 
 
 
466 aa  360  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 
461 aa  359  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  44.66 
 
 
465 aa  359  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  40.56 
 
 
462 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  39.52 
 
 
466 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  41.51 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  40.56 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.11 
 
 
458 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  44.94 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 
466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  46.07 
 
 
478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  42.33 
 
 
466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  41.89 
 
 
458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  42.05 
 
 
466 aa  355  7.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  41.61 
 
 
461 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  41.96 
 
 
458 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  43.2 
 
 
459 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>