More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2403 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  84.36 
 
 
455 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  100 
 
 
455 aa  916    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 
454 aa  608  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0264  argininosuccinate lyase  60.66 
 
 
462 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.139923 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  50.77 
 
 
466 aa  462  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26950  predicted protein  53.53 
 
 
442 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.66208  decreased coverage  0.00697045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  53.85 
 
 
459 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34526  predicted protein  51.82 
 
 
440 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
459 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
460 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
461 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  46 
 
 
461 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
464 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  47.87 
 
 
463 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
467 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
475 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62615  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
464 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.57732  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 
462 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  47.33 
 
 
461 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
456 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
462 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
467 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
460 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
464 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
462 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 
462 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
463 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
467 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
462 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
460 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
478 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
467 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
473 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
462 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
468 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
468 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
467 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 
458 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  44.18 
 
 
462 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
464 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
505 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.33 
 
 
459 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  49.43 
 
 
462 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
472 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 
491 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 
460 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 
460 aa  411  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  49.1 
 
 
466 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
459 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
468 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  49.17 
 
 
441 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
464 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
499 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  45.45 
 
 
458 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  49 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  47.43 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 
481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  47.43 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4071  argininosuccinate lyase  51.14 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  43.78 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  47.65 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0352  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843873  normal  0.960581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  46.27 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  48.24 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 
465 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  47.33 
 
 
462 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4195  argininosuccinate lyase  50.91 
 
 
467 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4220  argininosuccinate lyase  50.91 
 
 
467 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  46.51 
 
 
464 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  48.98 
 
 
460 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4045  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
470 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
485 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  47.33 
 
 
462 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 
504 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.7 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  48.56 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  45.73 
 
 
626 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.97 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>