More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  71.34 
 
 
476 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  72.53 
 
 
481 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  100 
 
 
478 aa  950    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  70.84 
 
 
500 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  75 
 
 
470 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
479 aa  634  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  67.52 
 
 
474 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  71.68 
 
 
472 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  67.65 
 
 
486 aa  624  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  66.18 
 
 
480 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  68.18 
 
 
472 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  70.28 
 
 
484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  71.36 
 
 
471 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  68.08 
 
 
463 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  70.24 
 
 
476 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 
502 aa  578  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  66.16 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  62.68 
 
 
482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  67.53 
 
 
485 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  59.08 
 
 
505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  64.05 
 
 
490 aa  558  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  68.35 
 
 
470 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  67.31 
 
 
495 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  60.95 
 
 
470 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  58.91 
 
 
487 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  67.69 
 
 
470 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  67.03 
 
 
470 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  68.5 
 
 
470 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
470 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
470 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  58.87 
 
 
511 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  60.53 
 
 
486 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  57.61 
 
 
464 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  58.7 
 
 
487 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  59.06 
 
 
472 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  56.86 
 
 
482 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  58.48 
 
 
472 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  59.16 
 
 
489 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 
475 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  51.5 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  51.52 
 
 
488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 
480 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  54.13 
 
 
477 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  53.91 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.65 
 
 
461 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  41.74 
 
 
461 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  45.99 
 
 
478 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
473 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 
455 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
458 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.28 
 
 
459 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
472 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  43.76 
 
 
466 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
458 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 
466 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
458 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 
456 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
466 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  43.26 
 
 
493 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
467 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  41.4 
 
 
441 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  45.72 
 
 
464 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 
463 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  43.75 
 
 
467 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
466 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5512  argininosuccinate lyase  46.9 
 
 
462 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  44.15 
 
 
466 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  45.13 
 
 
464 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  42.63 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
455 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  40.99 
 
 
458 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 
458 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.85 
 
 
471 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  47.73 
 
 
465 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  49.26 
 
 
459 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  46.36 
 
 
463 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 
462 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 
460 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3544  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 
452 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
464 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  42.08 
 
 
466 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  44.1 
 
 
441 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  42.63 
 
 
460 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 
469 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  45.14 
 
 
476 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  41.79 
 
 
466 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  46 
 
 
463 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  46 
 
 
466 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  41.7 
 
 
462 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
455 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  41.79 
 
 
504 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  41.69 
 
 
462 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 
487 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  41.69 
 
 
462 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  47.21 
 
 
505 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  41.69 
 
 
462 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  45.12 
 
 
469 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  43.57 
 
 
463 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  42.98 
 
 
458 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>