More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 
463 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  72.14 
 
 
486 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  71.31 
 
 
480 aa  683    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  78.71 
 
 
474 aa  744    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  77.16 
 
 
476 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  72.94 
 
 
465 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  78.91 
 
 
472 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  73.55 
 
 
472 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  83.12 
 
 
484 aa  741    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  75.68 
 
 
502 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  83.3 
 
 
471 aa  721    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  74.68 
 
 
481 aa  678    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  73.86 
 
 
479 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  75.48 
 
 
476 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  100 
 
 
500 aa  991    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  72.61 
 
 
470 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  70.84 
 
 
478 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  66.6 
 
 
490 aa  621  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  72.02 
 
 
485 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  64.97 
 
 
482 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  62.55 
 
 
505 aa  598  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  70.11 
 
 
495 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
470 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  62.74 
 
 
472 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  67.97 
 
 
470 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  70.35 
 
 
470 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  69.56 
 
 
470 aa  567  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  70.35 
 
 
470 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  70.35 
 
 
470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  60.75 
 
 
482 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  61.29 
 
 
464 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  60.55 
 
 
472 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  68.19 
 
 
470 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  61.77 
 
 
511 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  65.83 
 
 
486 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  60.39 
 
 
487 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  61.26 
 
 
487 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  59.87 
 
 
489 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.86 
 
 
475 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  54.01 
 
 
488 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
480 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.92 
 
 
477 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  50.87 
 
 
476 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.33 
 
 
461 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
459 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  48.6 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.56 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.64 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  46.46 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 
462 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
478 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 
462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  44.1 
 
 
463 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  44.03 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  44.2 
 
 
463 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 
461 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
462 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  44.03 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
441 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 
466 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 
458 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  47.85 
 
 
465 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  43.58 
 
 
458 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  44.03 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 
459 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
454 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  44.65 
 
 
441 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
464 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.97 
 
 
461 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  44.03 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
475 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
458 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 
457 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 
463 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 
464 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  46.34 
 
 
460 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 
469 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.56 
 
 
468 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  44.93 
 
 
457 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 
463 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.46 
 
 
471 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 
472 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
491 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.75 
 
 
467 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
458 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  46.79 
 
 
458 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  46.53 
 
 
463 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  46.89 
 
 
463 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 
458 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  45.23 
 
 
464 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 
460 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 
462 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
467 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
468 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 
463 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 
487 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  44.08 
 
 
476 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>