More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2024 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  73.09 
 
 
464 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  74.53 
 
 
511 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  83.12 
 
 
472 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  100 
 
 
482 aa  965    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  85.08 
 
 
472 aa  821    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  72.45 
 
 
489 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  65.12 
 
 
487 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  63.92 
 
 
470 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  67.92 
 
 
487 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  65.44 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  61.73 
 
 
472 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  61.12 
 
 
476 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  62.82 
 
 
472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  60.75 
 
 
500 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 
486 aa  548  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  60.55 
 
 
474 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  60.56 
 
 
463 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  62.77 
 
 
485 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  60.87 
 
 
479 aa  544  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  60.68 
 
 
465 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  60 
 
 
480 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  56.78 
 
 
476 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  61.1 
 
 
484 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  59.75 
 
 
476 aa  521  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  56.66 
 
 
475 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  59.12 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  61.22 
 
 
471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  57.82 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  57.72 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
505 aa  501  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  54.97 
 
 
482 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  57.62 
 
 
477 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  59.01 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.99 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.87 
 
 
480 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  60.26 
 
 
502 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  56.86 
 
 
478 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  58.44 
 
 
470 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  59.09 
 
 
470 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  58.04 
 
 
495 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  57.2 
 
 
470 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  57.2 
 
 
470 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  49.79 
 
 
488 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
465 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.74 
 
 
458 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 
459 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  45.15 
 
 
458 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 
462 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  47.76 
 
 
468 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 
459 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  45.2 
 
 
458 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  46.77 
 
 
481 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  51.52 
 
 
465 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
462 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.77 
 
 
461 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  45.28 
 
 
462 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  46 
 
 
460 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  44.9 
 
 
458 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  47.39 
 
 
462 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  44.21 
 
 
462 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 
463 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
464 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.99 
 
 
462 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  44.21 
 
 
463 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.99 
 
 
462 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.24 
 
 
475 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 
469 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  45.57 
 
 
458 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.99 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  43.99 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
467 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  46.06 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.17 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  45.31 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  42.89 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.32 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.74 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
458 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.67 
 
 
464 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  47.64 
 
 
467 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  48.48 
 
 
460 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.97 
 
 
461 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 
464 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
467 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
456 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  39.96 
 
 
466 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 
462 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  43.66 
 
 
461 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  45.26 
 
 
461 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  47.16 
 
 
462 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
461 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  47.51 
 
 
485 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  47.39 
 
 
476 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
459 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>