More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  70.19 
 
 		 474 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  82.22 
 
 		 463 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  72.59 
 
 		 481 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  72.02 
 
 		 472 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  72.94 
 
 		 500 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  70.13 
 
 		 476 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  74.68 
 
 		 482 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  76.74 
 
 		 485 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  74.29 
 
 		 495 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 465 aa  923    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  73.97 
 
 		 486 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  72.41 
 
 		 472 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  70.41 
 
 		 480 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  71.15 
 
 		 479 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  69.2 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  73.83 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  74.05 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  71.55 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  73.83 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  72.84 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  72.84 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  72.84 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  70.63 
 
 		 484 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  71.43 
 
 		 471 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  69.82 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  64.39 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  63.07 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  66.16 
 
 		 478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 		 505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  62.63 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  61.42 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  63.93 
 
 		 472 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  60.68 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  64.46 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  61.56 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  61.99 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  62.75 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  58.75 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  58.75 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.88 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  53.46 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 478 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 		 459 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  47.32 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.83 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  42.28 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.54 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.19 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  47.6 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 		 493 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  46.21 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  45.98 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.78 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  51.57 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  43.54 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.47 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.56 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.72 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  48.07 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  47.97 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.86 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.71 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  47.69 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  44.52 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  46.94 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  47.31 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.3 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  41.52 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  46.07 
 
 		 462 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  40.74 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.71 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  47.88 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>