More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6457 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  99.37 
 
 		 477 aa  949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  68.01 
 
 		 475 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  73.36 
 
 		 480 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 477 aa  957    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  65.95 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 		 488 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  56.93 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  56.99 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  57.79 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  57.71 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  57.11 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  58.8 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  56.38 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  56.4 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  58.75 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  56.44 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  56.62 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  55.9 
 
 		 472 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  58.58 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  55.27 
 
 		 476 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  54.51 
 
 		 479 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  57.89 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  53.21 
 
 		 480 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  55.25 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  55.67 
 
 		 484 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  56.37 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  55.39 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  53.58 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  53.91 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  51.41 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  54.93 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  56.74 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  51.29 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  53.1 
 
 		 490 aa  445  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 		 470 aa  428  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  54.61 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  53.5 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  44.57 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  42.95 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.59 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  41.29 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  44.86 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  46.64 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.62 
 
 		 459 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  43.54 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  40.57 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.53 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  44.97 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  40.18 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  45.11 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  43.52 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  41.7 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  38.31 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  39.87 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  42.01 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  44.93 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.39 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  43.24 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  40.94 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  42.73 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  39.47 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  43.24 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  42.17 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.1 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>