More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3022 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 486 aa  960    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  67.74 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  68.97 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  67.6 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  68.18 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  65.61 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  62.63 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  63.48 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  64.46 
 
 		 480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  63.91 
 
 		 487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  69.03 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  65.14 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  64.44 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  61.75 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  62.96 
 
 		 479 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  63.36 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  63.7 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  62.2 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  64.12 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  63.39 
 
 		 484 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  63.04 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  60 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  66.44 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  60.55 
 
 		 481 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  63.34 
 
 		 485 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  61.3 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  62.69 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  55.94 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  61.24 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  58.73 
 
 		 490 aa  510  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  60.74 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  61.93 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  56.47 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  52.42 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.01 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.37 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.93 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  46.3 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  46.89 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.77 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.67 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.65 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  46.44 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  48.11 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.91 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  48 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 		 478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  48.08 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.83 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.44 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.53 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  44.69 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.54 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  44.59 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.81 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  42.14 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  48.06 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  47.63 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.31 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  45.96 
 
 		 491 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  46.05 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  47.38 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  42.19 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>