More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1118 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  74.19 
 
 
476 aa  666    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  73.26 
 
 
472 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  71.15 
 
 
481 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  78.02 
 
 
484 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  70.19 
 
 
465 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  72.49 
 
 
476 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  68.23 
 
 
486 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  100 
 
 
474 aa  958    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  68.95 
 
 
480 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  78.71 
 
 
500 aa  744    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  70.37 
 
 
463 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  76.79 
 
 
471 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  68.51 
 
 
479 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  68.4 
 
 
472 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  68.87 
 
 
470 aa  626  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  65.11 
 
 
482 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  71.71 
 
 
502 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  67.52 
 
 
478 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  64.84 
 
 
490 aa  610  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  67.93 
 
 
495 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  68.04 
 
 
485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  62.91 
 
 
470 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  60.98 
 
 
505 aa  579  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  60.55 
 
 
482 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  64.87 
 
 
470 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  61.75 
 
 
511 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  60.43 
 
 
464 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  64.22 
 
 
470 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  58.3 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  61.12 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  58.92 
 
 
472 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  64.95 
 
 
470 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  64.44 
 
 
470 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  64.95 
 
 
470 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 
486 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  64.95 
 
 
470 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  56.32 
 
 
475 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  58.09 
 
 
487 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  60.75 
 
 
489 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 
480 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.62 
 
 
477 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.15 
 
 
488 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.4 
 
 
477 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  49.32 
 
 
478 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.97 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.98 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.64 
 
 
462 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  43.76 
 
 
463 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
461 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
462 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  45.88 
 
 
462 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  44.27 
 
 
459 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 
465 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 
476 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.54 
 
 
463 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
455 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
464 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
461 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
463 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 
460 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  43.59 
 
 
493 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  43.59 
 
 
466 aa  388  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  45.35 
 
 
481 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.09 
 
 
467 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.49 
 
 
461 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 
455 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 
466 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 
478 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  46.38 
 
 
464 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  45.17 
 
 
464 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 
468 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 
467 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  46.95 
 
 
465 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 
466 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 
441 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  42.95 
 
 
466 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
499 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  46.59 
 
 
463 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  44.03 
 
 
458 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 
468 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  46.61 
 
 
464 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
456 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 
473 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 
458 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
466 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  42.54 
 
 
504 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
469 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 
467 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  45.37 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  46.38 
 
 
464 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  43.54 
 
 
491 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.4 
 
 
471 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 
475 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>