More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3518 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  100 
 
 
476 aa  974    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  70.97 
 
 
475 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  66.17 
 
 
477 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  64.88 
 
 
480 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  65.95 
 
 
477 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
488 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  56.78 
 
 
482 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
472 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  56.84 
 
 
472 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
464 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  57.36 
 
 
511 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  56.44 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  56.07 
 
 
486 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  53.22 
 
 
470 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  52.93 
 
 
472 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  56.83 
 
 
489 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  56.87 
 
 
487 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 
463 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  50.96 
 
 
480 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  51.39 
 
 
479 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
474 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 
476 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  50.87 
 
 
500 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  53.46 
 
 
465 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  51.39 
 
 
481 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
484 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  50 
 
 
470 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  51.4 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  52.91 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  51.5 
 
 
478 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  48.38 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  51.96 
 
 
485 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
490 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
505 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
470 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
502 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  50 
 
 
470 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  50 
 
 
470 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  48.59 
 
 
495 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  50 
 
 
470 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  50 
 
 
470 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  42.73 
 
 
462 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  41.93 
 
 
458 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.33 
 
 
462 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  43.71 
 
 
461 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  42.44 
 
 
461 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  43.97 
 
 
456 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
462 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
463 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  43.11 
 
 
462 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  44.37 
 
 
468 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  41.43 
 
 
458 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
463 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.49 
 
 
459 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  38.91 
 
 
466 aa  381  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 
462 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  41.46 
 
 
461 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  42.13 
 
 
460 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  41.32 
 
 
458 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  41.39 
 
 
463 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
469 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  41.54 
 
 
458 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  41.12 
 
 
459 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
468 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  43.95 
 
 
461 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
499 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 
464 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 
459 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  42.73 
 
 
481 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  41.46 
 
 
459 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  41.67 
 
 
460 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 
458 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 
462 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  40.78 
 
 
466 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  40.78 
 
 
493 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  38.63 
 
 
462 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
464 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  39.34 
 
 
471 aa  371  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  41.1 
 
 
458 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 
461 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
459 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.01 
 
 
464 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  39.39 
 
 
460 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  39.69 
 
 
470 aa  369  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  41.41 
 
 
458 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  43.49 
 
 
464 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
505 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  43.84 
 
 
468 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  45.17 
 
 
475 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  44.42 
 
 
465 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  41.83 
 
 
462 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  42.67 
 
 
469 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>