More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  74.73 
 
 
500 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  100 
 
 
502 aa  993    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  70.47 
 
 
474 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  71.67 
 
 
476 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  76.29 
 
 
471 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  73.28 
 
 
484 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  71.1 
 
 
481 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  68.88 
 
 
480 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  71.67 
 
 
472 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  70.51 
 
 
479 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  67.58 
 
 
486 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  68.03 
 
 
472 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  70.09 
 
 
463 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  68.75 
 
 
470 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  70.54 
 
 
476 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  68.55 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  67.81 
 
 
478 aa  596  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  64.01 
 
 
482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  63.62 
 
 
490 aa  581  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  64.13 
 
 
470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
505 aa  561  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  67.39 
 
 
485 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  64.88 
 
 
495 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  62.78 
 
 
472 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  63.89 
 
 
470 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  61.43 
 
 
472 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  60.04 
 
 
464 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  65.03 
 
 
470 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  64.62 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  60.36 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  60.31 
 
 
482 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
487 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  62.63 
 
 
470 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  62.7 
 
 
486 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  59.15 
 
 
487 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 
489 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  54.37 
 
 
475 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  50.43 
 
 
488 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
476 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  51.57 
 
 
480 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  53.59 
 
 
477 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  53.59 
 
 
477 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.88 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.39 
 
 
461 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  49.36 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  46.54 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  51.82 
 
 
466 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.41 
 
 
458 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
441 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  44.01 
 
 
504 aa  388  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
460 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  46.52 
 
 
466 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  43.81 
 
 
466 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  41.92 
 
 
487 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  48.28 
 
 
455 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  43.61 
 
 
441 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.7 
 
 
461 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 
471 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 
456 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  46.5 
 
 
465 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.39 
 
 
461 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  42.6 
 
 
458 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  42.05 
 
 
462 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
458 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 
458 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 
467 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  46.61 
 
 
467 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
459 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
460 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  45.56 
 
 
464 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.11 
 
 
468 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
499 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  44.93 
 
 
473 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  43.72 
 
 
458 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 
468 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  45.79 
 
 
464 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  43.97 
 
 
458 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  45.86 
 
 
460 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
466 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  44.12 
 
 
469 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  46.93 
 
 
475 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  44.07 
 
 
467 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  44.74 
 
 
466 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  46.38 
 
 
460 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
464 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  43.52 
 
 
466 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
464 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  42.89 
 
 
466 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
464 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  43.67 
 
 
466 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 
455 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  46.15 
 
 
464 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.79 
 
 
464 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
464 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  44.77 
 
 
463 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  44.47 
 
 
469 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 
472 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>