More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3069 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  70.3 
 
 
487 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  100 
 
 
470 aa  939    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  70.51 
 
 
487 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 
464 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  65.73 
 
 
472 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  66.31 
 
 
511 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  63.92 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  64.58 
 
 
472 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  65.51 
 
 
476 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  64.36 
 
 
472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  62.91 
 
 
474 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  64.92 
 
 
472 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  64.67 
 
 
481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  63.77 
 
 
479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
500 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  63.12 
 
 
480 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  63.07 
 
 
465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  62.47 
 
 
486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  61.82 
 
 
463 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 
489 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  65.38 
 
 
502 aa  542  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  62.93 
 
 
476 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  64.35 
 
 
471 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  61.82 
 
 
484 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  61.62 
 
 
486 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  62 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  59.74 
 
 
482 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 
475 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  60.95 
 
 
478 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  62.39 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  62.64 
 
 
495 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  61.23 
 
 
470 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 
490 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  60.7 
 
 
470 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  60.22 
 
 
485 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 
470 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 
470 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.9 
 
 
477 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  53.22 
 
 
476 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  57.11 
 
 
477 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
480 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
505 aa  478  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
488 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  48.16 
 
 
458 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  46.03 
 
 
441 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.88 
 
 
458 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 
455 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  50.87 
 
 
505 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
463 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  45.2 
 
 
466 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  45.9 
 
 
460 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 
475 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 
462 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
459 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  47.81 
 
 
463 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
461 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  46.49 
 
 
459 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 
460 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
460 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  45.12 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  47.81 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  47.42 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.81 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  43.93 
 
 
458 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 
467 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  44.16 
 
 
461 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  48.08 
 
 
467 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
468 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 
473 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
462 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  43.81 
 
 
458 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  44.77 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.41 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  46.29 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  46.42 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  44.67 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  44.77 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  45.18 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.03 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  46.92 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  45.67 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.99 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
462 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  44.54 
 
 
481 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.89 
 
 
459 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 
464 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  44.52 
 
 
457 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
462 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 
462 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
462 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  47.54 
 
 
466 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
466 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  45.18 
 
 
469 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>