More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0248 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  68.42 
 
 
460 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  100 
 
 
466 aa  960    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  69.15 
 
 
460 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 
460 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  64.55 
 
 
466 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  64.33 
 
 
470 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.86 
 
 
468 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
461 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  53.24 
 
 
458 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  52.99 
 
 
467 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.8 
 
 
460 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.93 
 
 
475 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  51.96 
 
 
467 aa  476  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
458 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
462 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  52.68 
 
 
458 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  52.68 
 
 
458 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
463 aa  472  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  53.01 
 
 
478 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  53.15 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  52.56 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  51.42 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  53.1 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  53.3 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
456 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  51.3 
 
 
460 aa  464  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
462 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 
466 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 
468 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
463 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  52.88 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
467 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
466 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
462 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 
469 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
469 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
468 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
467 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
469 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  49.68 
 
 
504 aa  461  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
469 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  52.02 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  52.69 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  53.45 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  51.28 
 
 
493 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.42 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
466 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
465 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  51.68 
 
 
455 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
462 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  51.42 
 
 
468 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  53.1 
 
 
467 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50 
 
 
462 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 
485 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  52.47 
 
 
457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  51.99 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
463 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  51.85 
 
 
470 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  50.43 
 
 
472 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
486 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50 
 
 
461 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
464 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
467 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
466 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>