More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3075 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 455 aa  913    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  84.36 
 
 		 455 aa  783    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  64.76 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0264  argininosuccinate lyase  61.32 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.139923 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04420  argininosuccinate lyase, putative  50.33 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000251148  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26950  predicted protein  52.39 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.66208  decreased coverage  0.00697045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62615  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.57732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34526  predicted protein  51.16 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02914  arginosuccinate lyase (Eurofung)  46.74 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0370046  normal  0.061246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.9 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  46.89 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  50.8 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 468 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  44.22 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  48.24 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.52 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  43.78 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  46.95 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  48.11 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0352  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843873  normal  0.960581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4071  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.15 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  44 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4220  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 		 464 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4195  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  47.37 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.27 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 		 464 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  43.27 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  47.45 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  48.63 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  48.65 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  47.9 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  48.04 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  47.47 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  44.64 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  46.67 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  47.45 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  46.74 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 467 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  46.81 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  47.91 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  47.22 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  45.23 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  47.33 
 
 		 462 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>