More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0379 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  100 
 
 		 554 aa  1091    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  56.03 
 
 		 584 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  53.94 
 
 		 547 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  52.33 
 
 		 600 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  49.55 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  51.62 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  47.11 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.11 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.4 
 
 		 552 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  37.21 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  37.89 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  31.16 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.54 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.35 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 649 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  25.81 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.34 
 
 		 591 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  28.84 
 
 		 847 aa  150  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  23.71 
 
 		 579 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  23.71 
 
 		 579 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  24.67 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  26.02 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 		 572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  25.42 
 
 		 547 aa  146  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  25 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.58 
 
 		 605 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.47 
 
 		 602 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.42 
 
 		 593 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.97 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.14 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  23.73 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  24.49 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.76 
 
 		 578 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 		 559 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  24.42 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.17 
 
 		 562 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.82 
 
 		 847 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  24.63 
 
 		 566 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  26.34 
 
 		 550 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  23.28 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.28 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.31 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.64 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.74 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.41 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  24.31 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.88 
 
 		 605 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  25.9 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  25.9 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  23.44 
 
 		 534 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.06 
 
 		 592 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  23.9 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.87 
 
 		 610 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  26.18 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  23.56 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.84 
 
 		 593 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.84 
 
 		 593 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.84 
 
 		 593 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.26 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.18 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.44 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  25.89 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  26.45 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  26.27 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  26.27 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  26.27 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  26.27 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  25.23 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.39 
 
 		 552 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  26.2 
 
 		 547 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.23 
 
 		 574 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 576 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.68 
 
 		 564 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.51 
 
 		 580 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  26.72 
 
 		 547 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  25.42 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.84 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.84 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.95 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  25.87 
 
 		 591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.96 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.51 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.84 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  26.1 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  26.39 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.87 
 
 		 580 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.97 
 
 		 572 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  27.66 
 
 		 611 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.37 
 
 		 581 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  25.82 
 
 		 574 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  25.29 
 
 		 572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.68 
 
 		 580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.41 
 
 		 603 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.65 
 
 		 591 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>