More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0873 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
550 aa  1052    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.45 
 
 
552 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  50 
 
 
551 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  39.13 
 
 
550 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.77 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  40.67 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  37.35 
 
 
584 aa  273  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.99 
 
 
615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  35.82 
 
 
600 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  37.33 
 
 
554 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.45 
 
 
477 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  32.48 
 
 
550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.68 
 
 
557 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.85 
 
 
555 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.72 
 
 
558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.89 
 
 
567 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.81 
 
 
557 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.6 
 
 
578 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.39 
 
 
572 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.04 
 
 
572 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.08 
 
 
555 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.65 
 
 
579 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.56 
 
 
561 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.74 
 
 
610 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.84 
 
 
558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.84 
 
 
587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.57 
 
 
610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.12 
 
 
629 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.84 
 
 
587 aa  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.02 
 
 
587 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.71 
 
 
593 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.21 
 
 
574 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.71 
 
 
575 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.71 
 
 
575 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.86 
 
 
627 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.51 
 
 
608 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.84 
 
 
616 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.65 
 
 
607 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
556 aa  150  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
561 aa  150  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.54 
 
 
603 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  28.41 
 
 
564 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.86 
 
 
602 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  26.64 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  26.8 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.16 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.01 
 
 
597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.7 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.72 
 
 
564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.66 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.13 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.91 
 
 
572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.5 
 
 
569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.91 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  28.97 
 
 
622 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.91 
 
 
572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 
575 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.21 
 
 
605 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.7 
 
 
563 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.7 
 
 
574 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.06 
 
 
557 aa  148  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.81 
 
 
574 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.91 
 
 
572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.96 
 
 
572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
582 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.93 
 
 
566 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.6 
 
 
593 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.55 
 
 
603 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.67 
 
 
605 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.86 
 
 
563 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.6 
 
 
610 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 
572 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.73 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28 
 
 
572 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.12 
 
 
636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.55 
 
 
572 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.21 
 
 
605 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.4 
 
 
573 aa  146  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.69 
 
 
607 aa  146  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.41 
 
 
566 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
581 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
581 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 
566 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.21 
 
 
570 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.53 
 
 
587 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.53 
 
 
587 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.15 
 
 
591 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.53 
 
 
587 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.18 
 
 
585 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.27 
 
 
574 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.67 
 
 
574 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.45 
 
 
559 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.52 
 
 
562 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  26.32 
 
 
587 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.01 
 
 
572 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.75 
 
 
573 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  26.57 
 
 
582 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 
566 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1120  acetolactate synthase catalytic subunit  28.04 
 
 
566 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000146949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.11 
 
 
548 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>