More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4212 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
477 aa  952    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  54.88 
 
 
584 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  52.42 
 
 
600 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  54.35 
 
 
547 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  48.46 
 
 
550 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  48.82 
 
 
547 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  52.11 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.9 
 
 
615 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  35.61 
 
 
550 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.49 
 
 
552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  33.81 
 
 
551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  29.3 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.68 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.22 
 
 
552 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.19 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.48 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.99 
 
 
603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.99 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.46 
 
 
592 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.59 
 
 
607 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  27 
 
 
611 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.79 
 
 
580 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.34 
 
 
591 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.78 
 
 
605 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.72 
 
 
578 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.49 
 
 
557 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.5 
 
 
616 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  27.8 
 
 
570 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.42 
 
 
581 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.63 
 
 
529 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.31 
 
 
581 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  26.98 
 
 
590 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.4 
 
 
602 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.95 
 
 
581 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.7 
 
 
592 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.11 
 
 
592 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.47 
 
 
603 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  23.67 
 
 
566 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.23 
 
 
593 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.77 
 
 
605 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.66 
 
 
591 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.65 
 
 
610 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.29 
 
 
593 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.12 
 
 
610 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  22.71 
 
 
566 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.66 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.66 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.66 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.97 
 
 
605 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  23.17 
 
 
542 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.54 
 
 
573 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.45 
 
 
557 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  28.25 
 
 
576 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.38 
 
 
593 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  25.71 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  25.05 
 
 
847 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.61 
 
 
580 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.97 
 
 
584 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  22.49 
 
 
566 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.57 
 
 
584 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1120  acetolactate synthase catalytic subunit  23.21 
 
 
566 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000146949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
569 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.34 
 
 
593 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.34 
 
 
575 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.26 
 
 
574 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  25.56 
 
 
576 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.34 
 
 
575 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.16 
 
 
580 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.14 
 
 
572 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.14 
 
 
572 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
569 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.61 
 
 
568 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.34 
 
 
565 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  24.52 
 
 
847 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.15 
 
 
566 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.43 
 
 
588 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.24 
 
 
619 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.47 
 
 
579 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  22.05 
 
 
578 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.23 
 
 
548 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.58 
 
 
554 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.66 
 
 
552 aa  93.6  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.51 
 
 
572 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  22.05 
 
 
566 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.1 
 
 
588 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.37 
 
 
612 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.78 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  24.88 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.01 
 
 
571 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.69 
 
 
582 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.92 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.44 
 
 
587 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  25.44 
 
 
578 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
587 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  22.27 
 
 
566 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.53 
 
 
557 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  21.63 
 
 
534 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13507  acetolactate synthase large subunit ilvB2  26.73 
 
 
552 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>