More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08220 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  100 
 
 		 534 aa  1097    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  34.46 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  35.09 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  34.91 
 
 		 566 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  34.27 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  33.33 
 
 		 566 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.46 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.23 
 
 		 576 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.18 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 529 aa  280  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.4 
 
 		 574 aa  279  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  29.91 
 
 		 576 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  30.84 
 
 		 579 aa  277  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  31.38 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.17 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.83 
 
 		 591 aa  270  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  30.44 
 
 		 576 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  32.43 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  29.6 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  30.29 
 
 		 579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  30.29 
 
 		 579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  30.51 
 
 		 601 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.25 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  30.36 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.07 
 
 		 577 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  28.71 
 
 		 577 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  31.54 
 
 		 573 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  29.23 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  28.87 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  31.32 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  28.52 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.08 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  29.94 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  31.35 
 
 		 573 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  31.35 
 
 		 573 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.96 
 
 		 555 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  28.49 
 
 		 550 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  30.5 
 
 		 578 aa  259  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.53 
 
 		 569 aa  259  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  30.86 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  30.67 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  30.61 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  31.09 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  31.09 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  31.09 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.68 
 
 		 589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  28.89 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 649 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  29.6 
 
 		 572 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.43 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  30.9 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.76 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  32.77 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  29.93 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  29.55 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  29.63 
 
 		 550 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.59 
 
 		 561 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  29.63 
 
 		 550 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  30.6 
 
 		 572 aa  250  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.17 
 
 		 579 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.63 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  28.19 
 
 		 577 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.83 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  29.96 
 
 		 550 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.72 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.74 
 
 		 555 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  29.31 
 
 		 573 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.81 
 
 		 570 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.63 
 
 		 556 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.63 
 
 		 561 aa  246  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  32.27 
 
 		 560 aa  246  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.95 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.18 
 
 		 578 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  28.89 
 
 		 576 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 578 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.35 
 
 		 559 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  28.54 
 
 		 546 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  28.54 
 
 		 546 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  28.54 
 
 		 546 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.07 
 
 		 576 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  28.93 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  28.22 
 
 		 590 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.89 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  30.95 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.23 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.4 
 
 		 557 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  29.18 
 
 		 586 aa  240  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  28.84 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.09 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  27.65 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>