More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0969 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  86.41 
 
 
551 aa  886    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
552 aa  1087    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  49.81 
 
 
550 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.18 
 
 
547 aa  319  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  38.09 
 
 
550 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  36.76 
 
 
547 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  34.75 
 
 
584 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.97 
 
 
615 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.14 
 
 
554 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  33.84 
 
 
600 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  31.73 
 
 
550 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.49 
 
 
477 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
557 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.4 
 
 
567 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 
556 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 
561 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.88 
 
 
547 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
608 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
570 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  28.78 
 
 
578 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  31.19 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.4 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.65 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.97 
 
 
592 aa  134  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.54 
 
 
566 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  28.07 
 
 
577 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 
574 aa  133  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.88 
 
 
607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.52 
 
 
557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 
599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.06 
 
 
558 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.7 
 
 
559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.44 
 
 
605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.49 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.54 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.9 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.9 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.5 
 
 
564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.74 
 
 
571 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.22 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.69 
 
 
554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  25.24 
 
 
542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.03 
 
 
521 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.92 
 
 
566 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.58 
 
 
571 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.67 
 
 
587 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.5 
 
 
562 aa  127  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.67 
 
 
554 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.77 
 
 
591 aa  127  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  26.08 
 
 
568 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.89 
 
 
610 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.35 
 
 
603 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.38 
 
 
563 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.22 
 
 
555 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.72 
 
 
571 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.43 
 
 
570 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.78 
 
 
587 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.44 
 
 
616 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.89 
 
 
610 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  26.45 
 
 
564 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.72 
 
 
605 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.51 
 
 
571 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.61 
 
 
573 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.25 
 
 
587 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  27.51 
 
 
569 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.02 
 
 
566 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.16 
 
 
563 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.92 
 
 
552 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.19 
 
 
569 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.95 
 
 
581 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.1 
 
 
564 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  25.54 
 
 
546 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 
558 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
581 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  25.71 
 
 
555 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.99 
 
 
548 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
581 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.29 
 
 
587 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.8 
 
 
561 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.13 
 
 
572 aa  124  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.41 
 
 
569 aa  123  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  27.55 
 
 
570 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.71 
 
 
573 aa  123  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.38 
 
 
565 aa  123  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.89 
 
 
605 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.19 
 
 
598 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.38 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.19 
 
 
607 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.19 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.99 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  25.29 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>