More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3916 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
550 aa  1117    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  32.84 
 
 
550 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.91 
 
 
547 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  32.31 
 
 
547 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  30.53 
 
 
584 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.73 
 
 
552 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.33 
 
 
615 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  33.59 
 
 
551 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.71 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
563 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  29.89 
 
 
554 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.52 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.74 
 
 
605 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.84 
 
 
578 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  27.34 
 
 
572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.67 
 
 
605 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.08 
 
 
605 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.31 
 
 
610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.55 
 
 
607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.98 
 
 
610 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.97 
 
 
616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.27 
 
 
557 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.08 
 
 
582 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.97 
 
 
603 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.97 
 
 
610 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  32.48 
 
 
550 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  26.89 
 
 
600 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.48 
 
 
603 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
557 aa  161  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 
562 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.38 
 
 
566 aa  160  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.5 
 
 
555 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.41 
 
 
559 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.44 
 
 
563 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 
556 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 
569 aa  159  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 
561 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.95 
 
 
555 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.83 
 
 
556 aa  157  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.84 
 
 
580 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.84 
 
 
580 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
558 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.22 
 
 
587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  26.81 
 
 
566 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.85 
 
 
562 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.3 
 
 
580 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.91 
 
 
587 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.19 
 
 
562 aa  154  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.67 
 
 
617 aa  153  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08530  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.88 
 
 
633 aa  154  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0564947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  26.5 
 
 
572 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.86 
 
 
570 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2671  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 
570 aa  153  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.343163  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  26.63 
 
 
566 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.27 
 
 
574 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.18 
 
 
587 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  27.09 
 
 
622 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27 
 
 
529 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.05 
 
 
581 aa  150  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.64 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  26.09 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.55 
 
 
568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.22 
 
 
558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  28.52 
 
 
623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.73 
 
 
568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.26 
 
 
569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  28.55 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.86 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.86 
 
 
581 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.53 
 
 
581 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.37 
 
 
567 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26 
 
 
587 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.4 
 
 
593 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  26.92 
 
 
578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.63 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.22 
 
 
572 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  26.09 
 
 
566 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.63 
 
 
555 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.7 
 
 
619 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.23 
 
 
564 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  25.36 
 
 
566 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.33 
 
 
573 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.74 
 
 
593 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  25.77 
 
 
599 aa  144  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27 
 
 
558 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.13 
 
 
589 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  25.19 
 
 
574 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 
553 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.09 
 
 
573 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  27.64 
 
 
569 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.97 
 
 
554 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.91 
 
 
583 aa  143  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.82 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  25.87 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.42 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  26.7 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.21 
 
 
619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  25.95 
 
 
566 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.94 
 
 
587 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>