More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1505 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
600 aa  1182    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  60.48 
 
 
584 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  55.26 
 
 
547 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  49.92 
 
 
550 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  48.09 
 
 
547 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  51.66 
 
 
554 aa  475  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.79 
 
 
615 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  34.88 
 
 
551 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.95 
 
 
552 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.28 
 
 
564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.8 
 
 
578 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  26.89 
 
 
550 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  30.05 
 
 
611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  36.93 
 
 
550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  24.66 
 
 
534 aa  157  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.15 
 
 
562 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.71 
 
 
565 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  24.96 
 
 
587 aa  144  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3747  acetolactate synthase catalytic subunit  29.23 
 
 
581 aa  144  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.79 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.74 
 
 
581 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.68 
 
 
554 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  23.69 
 
 
547 aa  137  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  24.91 
 
 
552 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  24.57 
 
 
587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.04 
 
 
649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.75 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.29 
 
 
573 aa  135  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.51 
 
 
571 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.5 
 
 
549 aa  135  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.93 
 
 
592 aa  135  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  26.12 
 
 
551 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  27.02 
 
 
622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.93 
 
 
592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.83 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.26 
 
 
568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.13 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  24.24 
 
 
587 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  25.96 
 
 
562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.33 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.09 
 
 
573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.04 
 
 
572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.58 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.43 
 
 
572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  24.56 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  27.62 
 
 
847 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  24.27 
 
 
587 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.19 
 
 
600 aa  131  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  22.62 
 
 
555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  24.26 
 
 
566 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.61 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1253  putative acetolactate synthase large subunit  26.89 
 
 
595 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713143  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.61 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.44 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.44 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.61 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  24.96 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.61 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.61 
 
 
572 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26 
 
 
573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.65 
 
 
562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.82 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  26.1 
 
 
596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.55 
 
 
572 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 
556 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.39 
 
 
573 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.61 
 
 
636 aa  128  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  24.87 
 
 
599 aa  128  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.4 
 
 
584 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  28.28 
 
 
534 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  24.66 
 
 
545 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
564 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  26.31 
 
 
847 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.35 
 
 
573 aa  127  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25 
 
 
593 aa  127  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.52 
 
 
573 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  24.25 
 
 
560 aa  127  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.25 
 
 
574 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25 
 
 
575 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.22 
 
 
557 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25 
 
 
575 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.15 
 
 
608 aa  126  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.69 
 
 
572 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.67 
 
 
555 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.38 
 
 
572 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.09 
 
 
563 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.42 
 
 
572 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.42 
 
 
572 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.15 
 
 
574 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.28 
 
 
572 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  21.98 
 
 
570 aa  125  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  24.36 
 
 
550 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.59 
 
 
618 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  24.74 
 
 
591 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  24.36 
 
 
550 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.83 
 
 
563 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.67 
 
 
599 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.09 
 
 
563 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>