More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1253 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1253  putative acetolactate synthase large subunit  100 
 
 
595 aa  1202    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713143  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  49.83 
 
 
583 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5588  thiamine pyrophosphate protein central region  49.41 
 
 
583 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  39.18 
 
 
563 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  38.79 
 
 
611 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.08 
 
 
564 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.21 
 
 
565 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  35.71 
 
 
551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2846  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.42 
 
 
574 aa  286  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.17 
 
 
574 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.12 
 
 
574 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.99 
 
 
572 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.98 
 
 
581 aa  267  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.81 
 
 
581 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  30.57 
 
 
599 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.83 
 
 
573 aa  265  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.04 
 
 
572 aa  264  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  31.02 
 
 
567 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.64 
 
 
572 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.39 
 
 
572 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.85 
 
 
572 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
573 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
573 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.02 
 
 
565 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.39 
 
 
562 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  28.72 
 
 
587 aa  257  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.21 
 
 
566 aa  256  7e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
573 aa  256  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31 
 
 
563 aa  256  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.69 
 
 
569 aa  256  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.94 
 
 
558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 
554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.46 
 
 
563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.87 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.68 
 
 
572 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.84 
 
 
566 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.53 
 
 
569 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.14 
 
 
574 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.06 
 
 
559 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  29.07 
 
 
577 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.82 
 
 
573 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  28.37 
 
 
587 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.55 
 
 
587 aa  250  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 
618 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.52 
 
 
573 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.83 
 
 
555 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.96 
 
 
573 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.93 
 
 
563 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  29.71 
 
 
578 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.2 
 
 
636 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
564 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  29.93 
 
 
574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  29.93 
 
 
574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 
566 aa  246  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.81 
 
 
572 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.93 
 
 
574 aa  246  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.93 
 
 
574 aa  246  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.93 
 
 
574 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.93 
 
 
574 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.6 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.47 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.93 
 
 
574 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.93 
 
 
604 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.71 
 
 
588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 
562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.8 
 
 
562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 
619 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.13 
 
 
573 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.21 
 
 
572 aa  243  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.21 
 
 
559 aa  243  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.67 
 
 
587 aa  242  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.84 
 
 
584 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 
593 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 
575 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 
575 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 
563 aa  241  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.57 
 
 
584 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.9 
 
 
554 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.84 
 
 
584 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.75 
 
 
566 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.39 
 
 
565 aa  240  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.91 
 
 
584 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.49 
 
 
584 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.65 
 
 
535 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  28.52 
 
 
589 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  28.52 
 
 
589 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.16 
 
 
566 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.47 
 
 
623 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  29.82 
 
 
585 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.52 
 
 
587 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.4 
 
 
574 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  28.67 
 
 
566 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.04 
 
 
566 aa  237  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.24 
 
 
558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>